Pelaksanaan vaksinasi dilakukan dengan cara mengumpulkan semua ayam dalam sekat waring yang telah dipasang di dalam kendang, dan vaksinasi dilakukan dari dalamsekat.
Ayam yang sudah selesai divaksin kemudian dikeluarkan dari sekat tersebut. Kegiatan vaksinasi harus memperhatikan kondisi ayam.Ayam yang akan divaksin tidak boleh berkumpul disa tutitik dalam jumlah yang sangat banyak. Ayam yang berkumpul disudut kendang dalamjumlah yang banyak biasanya akan menyebabkan ayam mengalami heat stress dan menjadi sesak napas dan dapat menyebabkankematian.
Kegiatanvaksinasi yang dilakukansebisamungkintidakmenyebabkan stress padaayamsehinggapembentukan antibody dapat optimal. (*)